Doktorandplats i biofysik inom högupplöst röntgenavbildning av nematoder

Göteborgs universitet möter samhällets utmaningar med mångsidig kunskap. 56 000 studenter och 6 600 medarbetare gör universitetet till en stor och inspirerande arbetsplats. Stark forskning och attraktiva utbildningar lockar forskare och studenter från hela världen. Med ny kunskap och nya perspektiv bidrar Göteborgs universitet till en bättre framtid.

Doktorandplats i biofysik inom högupplöst röntgenavbildning av nematoder

Vid institutionen för kemi och molekylärbiologi bedrivs forskning och forskarutbildning inom ett brett område som sträcker sig hela vägen från atom- och molekylskala via celler till hela organismer. Mycket av de fenomen som studeras har en inverkan på vår naturliga miljö och levande system. Vi deltar i utbildning på grundläggande nivå inom programmen för kemi, molekylärbiologi, läkemedelskemi, biologi, marina vetenskaper och apotekarprogrammet.

Med stöd från Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse arbetar Richard Neutze tillsammans med Julia Morud Lekholm och Johanna Höög mot målet att förstå hur ett utvecklat biologiskt neuronalt nätverk fungerar för att bearbeta information. Vi fokuserar på neuron i Caenorhabditis elegans, en rundmask (nematod) som är det enklaste kända modellsystemet inom neurovetenskap. Det hermafrodita djuret har 302 nervceller. En nyckelteknik inom Wallenberg Scholar-projektet är röntgenavbildning av det neurala connectomet (kopplingarna mellan nervcellerna) hos C. elegans. Denna doktorandtjänst syftar därför till att använda röntgenavbildning för att kartlägga de rumsliga arrangemangen av, och kopplingarna mellan, nervceller i rundmaskar. Den planerade forskningen kommer att utveckla grunderna för mycket högupplöst röntgenavbildning av biologiska prover genom att använda högtrycksfrysningsmetoder för att förbereda nematodprover för att sedan bädda in dem i epoxiplast. Sedan ska kvaliteten på provberedningsprocessen utvärderas med hjälp av transmissionselektronmikroskopi. Doktoranden kommer att delta i röntgenavbildning av dessa prover vid synkrotronstrålningsanläggningar och att lära sig bildbehandling och datorstödda rekonstruktionsmetoder. En mängd olika härdplaster kommer att testas för att utvärdera deras kvalitéer för röntgenavbildning. När robusta, högkvalitativa provberednings- och analysprotokoll har utvecklats är målet att rekonstruera connectomet hos C. elegans från ett helt intakt djur med hjälp av synkrotronstrålning. Maskininlärningsmetoder kommer att användas när denna rekonstruktion utförs. Denna doktorandtjänst kombinerar således både preparativa laborationer med beräkningsverktyg samt användning av synkrotronstrålning för strukturell analys.

Universitetsgemensam information om vad det innebär att vara doktorand vid Göteborgs universitet kan du finna på universitetets doktorandsidor.

https://www.gu.se/utbildning-till-att-bli-forskare

Arbetsuppgifter

Doktoranden kommer att arbeta med att utveckla verktyg för mycket högupplöst röntgenavbildning av biologiska prover med hjälp av synkrotronstrålning. Detta arbete innebär:

• Användning av högtrycksfrysningsmetoder för att förbereda nematodprover.

• Inbäddning av frysta nematoder i härdplaster.

• Utvärdering av kvaliteten på provberedningsprocessen med hjälp av transmissionselektronmikroskopi.

• Deltagande i röntgenavbildning av dessa prover vid synkrotronstrålningsanläggningar.

• Använda datorpaket för bildbehandling för att analysera dessa data och generera tredimensionella rekonstruktioner.

• Använda maskininlärningsverktyg för att spåra kopplingar mellan nervceller i tredimensionella rekonstruktioner.

Beroende på den utnämnda studentens intressen kan arbetet också omfatta stödjande arbete med proteinmål från C. elegans eller simuleringar av djurets neuronala connectome.

Forskarutbildning omfattar fyra års heltidsstudier och leder fram till en doktorsexamen.

Inom ramen för din doktorandanställning kan du ha institutionstjänstgöring i en omfattning av max 20 % av heltid fördelat under hela utbildningstiden vilket i så fall genererar motsvarande förlängning av utbildningstiden. Institutionstjänstgöring omfattar vanligtvis undervisning på grundnivå och avancerad nivå, men även forskning och administration kan ingå.

Behörighet

För tillträde till forskarutbildning på forskarnivå krävs grundläggande och i förekommande fall den särskilda behörighet som är fastställd i den allmänna studieplanen för forskarutbildningsämnet.

Grundläggande behörighet till forskarutbildning på forskarnivå har den som:

Särskild behörighet har den som har:

För särskild behörighet krävs också att sökande behärskar engelska i tal och skrift på en godtagbar nivå. Som riktmärke gäller 550 poäng på TOEFL-test (eller 213 poäng på TOEFL-CBT, eller 79 poäng på TOEFL-iBT).

Bedömningsgrund

Urval bland sökande som uppfyller krav på grundläggande och särskild behörighet baseras på förmågan att tillgodogöra sig forskarutbildningen.

Vid bedömningen fästs särskild vikt vid dokumenterade kvalifikationer avseende:

Bakgrund och meriter som student på masternivå inom naturvetenskap.

Förmåga att ta initiativ och vilja att pröva nya saker.

Personlig motivation och intresse för naturvetenskap.

Rekommendationer från personal som har arbetat med den sökande.

Kandidater kommer att väljas ut och ett fåtal kommer att kallas till intervju i Göteborg.

Antagning och anställning

Efter du har blivit antagen till forskarutbildning kommer du att erhålla en doktorandanställning vid Göteborgs universitet.

Bestämmelser för anställning som doktorand återfinns i förordning SFS 1993:100.

Den första anställningen som doktorand får gälla högst ett år och får förnyas med högst två år i taget.

En doktorand får som längst vara anställd som doktorand under åtta år men den sammanlagda anställningstiden får inte vara längre än vad som motsvarar utbildning på forskarnivå på heltid under fyra år.

Anställningsform: Tidsbegränsad anställning, fyra år

Omfattning: 100 %

Placering: Institutionen för Kemi och molekylärbiologi, Göteborg

Tillträde: Snarast enligt överenskommelse

Förutom skyldighet att ägna sig åt egen forskarutbildning kan innehavaren åläggas att fullgöra tjänstgöring som avser utbildning, forskning och administrativt arbete enligt särskilda bestämmelser i förordningen.

Universitetet tillämpar lokalt avtal om lönesättning av doktorander.

Forskarutbildningen vid institutionen för kemi och molekylärbiologi kräver fysisk närvaro för att genomföra studierna. Om den som antas behöver uppehållstillstånd för att bedriva studier i Sverige, har institutionen för kemi och molekylärbiologi rätt att återkalla beslut om antagning i det fall den antagne inte kan uppvisa ett giltigt uppehållstillstånd vid datumet för studiestart.

Kontaktuppgifter för doktorandplatsen

Richard Neutze: [email protected]

Julia Morud Lekholm: [email protected]

Johanna Höög: [email protected]

Fackliga organisationer

Fackliga företrädare vid Göteborgs universitet hittar du här:
https://www.gu.se/om-universitetet/jobba-hos-oss/hjalp-for-sokande

Ansökan

Du ansöker om att bli antagen till forskarutbildning via Göteborgs universitets rekryteringsportal.

Du som sökande ansvarar för att ansökan är komplett i enlighet med annonsen och att den är universitetet tillhanda senast sista ansökningsdag.

Komplett ansökan innehåller i PDF-format:

• Personligt brev
• CV
• Bevis om examen på avancerad nivå eller fullgjorda kurser, se behörighetskrav ovan
• Bevis om slutförd kurs i Engelska 6 eller motsvarande (gymnasiebetyg eller motsvarande)
• Två referenser (namn, mailadress, telefonnummer, relation)

För sökande med utländsk examen
Om examen är från lärosäte utanför Sverige ä du skyldig att informera dig om vad som gäller för just det landet https://www.antagning.se/sv/Hur-du-anmaler-dig-och-haller-koll/magister-och-master/for-dig-med-utlandsk-kandidatexamen/dokument-fran-ditt-utbildningsland/ - där finns även information om hur det särskilda behörighetskravet i engelska kan uppfyllas.

Ange i din ansökan en kontakt (telefonnummer eller e-post) till utfärdande lärosäte som kan verifiera examen.

Ansökan ska vara inkommen senast: 2025-07-10

Universitetet arbetar aktivt för en arbetsmiljö med jämställda förhållanden och sätter värde på de kvalitéer mångfald tillför verksamheten.

Universitetet tillämpar individuell lönesättning.

Enligt Riksarkivets föreskrifter är universitetet skyldigt att förvara ansökningshandlingar i två år efter tillsättningsbeslutet. Om du som sökande till en anställning särskilt begär tillbaka dina handlingar återsänds de när de två åren har förflutit, i annat fall kommer de att gallras ut.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Göteborgs universitet anlitar upphandlad annonsbyrå i samband med rekrytering av personal. Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av jobbannonser.